Film, Superman olarak bilinen Clark Kent ve Batman olarak tanınan Bruce Wayne'in hikayelerini birleştirir. Gotham City'de adaleti sağlamaya çalışan Batman ile Metropolis şehrinde güçlerini kullanarak dünyayı korumaya çalışan Superman arasında gerilim başlar. İkinci filmin ana antagonisti ise, dahi suç dehası Lex Luthor tarafından canlandırılır. Luthor, kahramanlar arasında bir çatışmayı tetiklemek ve onları birbirine düşürmek için karanlık planlar yapar. Film, kahramanlarımızın kişisel zaaflarını, sıradan insanlar tarafından tanrılara karşı olan korkularını ve etik sorunlarını ele alır. Batman'in, Gotham'da yaptığı gizli savaşla, Superman'in dünya genelinde tanrısal güçleriyle etkileşimine odaklanır.
