1868'de birçok gemi gizemli bir şekilde okyanusta batmıştır. Söylentiye göre bu saldırılar dev bir deniz canlısı tarafından olmuştur ve tüm denizciler artık bu esrarengiz yaratıktan korkmaktadır. Olayın kökenini araştırmak için gönderilen askeri gemi de aynı akıbete uğradı, gemide bulunan Profesör Pierre Arronax ve onun yardımcısı bu yüksek teknolojili aracın garip kaptanı Nemo, onları karşılar ve görevi hakkında onlara bazı bilgiler verir. Bu artık insanlar ve bir deniz canavarı arasındaki savaştır.
