Gerçek olaylardan esinlenen kurumsal bir gerilim filmi olan Protocol 7, bizi büyük bir ilaç şirketinin, başarısız bir kabakulak aşısının arkasındaki sahte test sonuçları için hesap vermeye zorlamak üzere bir araya gelen üç kişinin öyküsüne götürüyor. Alexis Koprowski, adanmış bir anne ve küçük bir kasabanın aile avukatı; Adrian Jay, tıp mesleğinden sürgün edilmiş asi bir doktor; ve Steve Schilling, ünlü bir aşı laboratuvarında virolog ve şirket içi yolsuzlukları ifşacı olarak görev yapıyor. Bu üçlü, büyük bir ilaç şirketinin sorumluluktan kaçınan, karları insanların üzerindeki önceliğe koyan amoral bir zihniyeti teşvik eden iç yapısını ortaya çıkarmak için iş birliği yapar.