Kaptan Kirk ve mürettebatı Enterprice’ı onarımlar için Uzay Üssü'ne gönderirler. Ancak, acil bir görev, onların Dünya'da dinlenmeye alıştıkları sırada beklenmedik bir şekilde ortaya çıkar. Bir isyankar Vulcan olan Sybok, Galaktik Barış Gezegeni Nimbus III üzerinde üç elçiyi rehin almıştır. Bu olay, kendine bir ün yapmak isteyen bir Klingon kaptanının dikkatini çeker ve Enterprise'ın peşine düşer. Sybok'un karışık ordusu, Enterprise'ı ele geçirir ve onu Galaksi'nin merkezine doğru bir yolculuğa çıkarır, Yüce Varlık'ı aramak için.Kaptan Kirk, gemisi Enterprise'ı uzayın derinliklerine doğru yönlendirdiğinde, mürettebatıyla birlikte maceranın eşiğine gelir.
